При изменении реквизита документа, конфигурация при сохранении начинает шерстить все документы. База файловая, большая, этот процесс долгий. Можно как-то сохранить без проверки?

можно. удалить документы, сохранить, закачать документы.

Ну и пусть шерстит. Это ж не 40 раз на дню...

(0) Менял как-то одному клиенту в справочнике реквизит Строка.6 на Строка.12 . в таблице было несколько десятков миллионов записей.
подсчитал по строке состояния, что на это уйдет несколько часов. Прервал, нашел по 1cv7.dd какая это таблица. Убрал ее из каталога БД в другой.
Обновил конфигурацию. Машина создала новую таблицу на справочник. Далее открыл в FoxPro ранее скопированную таблицу. Поменял структуру. И скопировал в БД. Все. Ушло пару минут.

(3) Индексы не забыть

(4) ну если, только реквизит входит в индекс, то да,просто удалить