Есть два типовых отчета: ведомость по товарам на складах и ведомость тмц в эксплуатации. Оба отчета обращаются к виртуальной таблице ОстаткиИОбороты соответствующих регистров. В обоих отчета в настройках скд есть группировка по регистратору (в первом отчете это типовая настройка, во втором - пользовательская). Во втором отчете остатки рассчитываются неверно: если развернуть дерево и сложить все строки, то их сумма не будет равна сумме в группировке выше (для начальных остатков, например, сумма по строкам больше суммы в группировке выше). Если группировку по регистратору убрать, то рассчитывается все верно.
В обоих отчетах присутствует ПериодСекунда, заданы роли, для регистратора - игнорировать null. Что можно еще проверить?

Оставил минимальный набор данных. Начальный остаток в этом скриншоте вывелся верно, конечный нет. В конечном остатке хотел бы видеть 188
https://screenshare.ru/s/DCoEEHi7mZXzknZpUoW6BL

У тебя похоже регистратор не задан как период

(2) Период, 1, NULL

Ну и вообще если есть 2 отчета один работающий, а другой нет, проще сравнить их настройки между собой чем тут гадать

(4) в этом и проблема, что я не вижу разницы...

А если убрать все пользовательские настройки и с 0 запустить два отчета?

(6) тоже самое. Пользовательская настройка - это добавление группировки по регистратору.

в итоге сделал, тупо разбив запрос на: начальные остатки + обороты + конечные остатки