Можно ли в журнале регистрации увидеть события запуска внешних обработок и отчетов и сделать отбор по таким событиям? Если да, то как это сделать?

нет

Если специально этого не делать

Делайте запись в ЖР (а лучше в отдельное хранилище данных) и пишите события. Кто, что и когда открывал.

Нельзя.
Можно правами запретить запуск внешних отчетов и обработок а для подключенных прописать принудительную запись в ЖР при запуске.

А из технического журнала можно как то получать такие данные?

(5) нет.

И это, кстати, недоработка платформы. Безопасный режим сделали, а аудита его соблюдения нет.

Надо написать вирус, подменяющий реквизиты в платежках. Тогда сделают.

(8) мало тебе каждый раз при добавлении внешней в справочник предупреждения?

(9) Пусть не предупреждает а пишет молча в ЖР

(0) если внешний отчет или обработка будут обращаться к серверу (запрос или изменение данных), то в серверном ТЖ появятся записи об этом, других событий по ним нет

+(11) см событие CALL