Рисуем новый детектор в котором проверяем состояние информационной базы и понимаем, что событие произошло.
Регламент по обработке детекторов регистрирует событие, не проверяя контекст события на уникальность. Таким образом при повторной обработке регламента данное событие будет зарегистрировано не один раз.
Для решения вопроса в детекторе анализировал наличие события в регистре произошедьших событий по ключу ВидСобытия + Источник.

По идее реализация детектора не должна опираться на реализацию внутреннего механизма конфигурации.
Быть может, я чего-то не заметил. Может есть другие пути предотвращения дублей?