создаем на основании Реализации документ Корректировка реализации (Во всех разделах учета). создаем исправительную счет-фактуру. Запускаем обработку Проведение документов по регистрам НДС

при заполнении Формирование записи в книгу продаж данные не подтягиваются.  их нужно вручную создать?

Разобрался. Формирование книги продаж можно не заполнять. После обработки "Проведение документов по регистрам НДС" данные попадают в доп.лист отчета "Книга продаж"