ЗУП 2.5.106.1
У сотрудника имеется командировка с 23.05 по 31.05 создал Док.КомандировкиОрганизаций  С 23.05 - 31.05 3 дня в дороге.
Далее создал Док.ОплатаПоСреднемуЗаработку, насчитал 889,77 за 7 рабочих дней.
Далее заполнил табель.
Далее создал начисление и сделал выплату. В док.ВыплатаЗПОрг попала сумма 889,7 116 в отложено. Далее создал расходник, добавил выплату и провел. Как итог в РН.НдфлРасчетыСБюджетом и РН.РасчетыНалоговыхАгентовСБюджетомПоНДФЛ попала сумма не 116 а почемуто 29...
Что-то не получается разобрать, откуда ноги растут...

У нас такие ноги растут во всех межрасчётных выплатах после обновы на 106.1 версию.

И что делать? Заливать из бэкапа?

Так как у нас снята с поддержки, я просто нашла место "ног", а именно Общие модули/ПроведениеРасчетов и процедуру "СформироватьРасчетыПоНДФЛПриВыплате" (а косяк был в ней) залила из 105 версии. Если есть возможность/время попробуй проверить.
Свою ситуацию описала в письме тех. поддержки 1с - жду ответа 2 дня уже.
З.Ы. 107 версия не исравила ошибки

Спасибо, хотя бы есть куда копать