Создаю на основании элемента справочника бизнес-процесс. Вывести его в структуре подчиненности реально?

Критерий отбора, не?

Критерий отбора это да, но далее используется общая форма Структура подчиненности, в которой мы видим такой кусочек:

&НаСервере
Функция ОсновнойДокументДоступен()

    Запрос = Новый Запрос(
    "ВЫБРАТЬ РАЗРЕШЕННЫЕ
    |    1
    |ИЗ
    |    Документ." + ДокументСсылка.Метаданные().Имя + " КАК Таб
    |ГДЕ
    |    Таб.Ссылка = &ТекущийДокумент
    |");
    Запрос.УстановитьПараметр("ТекущийДокумент", ДокументСсылка);
    Возврат Не Запрос.Выполнить().Пустой();

КонецФункции

Тебе так и так переписывать что-то придется

(3) С учетом того, что ты для ДокументСсылка собираешься использовать справочник)