Организация покупает б/у автомобиль у частного лица, База по НДС  в данном случае, это  разница между суммой продажи и суммой покупки.  НДС в данном случае нужно начислять исходя из этой суммы.

Как нам реализовать это в УТ 11.1? Если вручную скоректировать суммы, то программа ставит их как скидку. В Бухгалтерии 8 мы бы сделали Реализацию+Отражение начисления НДС.

ап

А нет конфигурации "1С: Перекуп авто"?

(2) можно купить или написать:) Но в данном случае речь про ут

(3) Никогда с УТ 11 не работал((
В УПП 1.3 (и, наверное, УТ 10.3) можно выдать счет фактуру на суммовую разницу. В УТ 11 ничего подобного нет?