есть какой способ найти эти зловредные объекты метаданных? пока приходит на ум только перебор метаданных с подсчетом количества типов, используемых в реквизитах

тебе все равно до типов реквизитов придется добираться.
Ну и посмотри  у них .Количество()

а что говорит ТипЗнч() на известном реквизите?