В среднем каждую третью смену одному из множества чеков не присваивается номер по порядку, при этом номер смены для данного чека в форме списка = 999, в то время, как по другим чекам поле "смена" остается пустым. Таким образом, чек в отчет о розничных продажах попадает, а на фискальник не уходит, из-за этого расхождение по суммам.
(Конфа типовая,явление наблюдается на нескольких перифериях, то есть дело не в фискальнике)