Если для документа установлена автогреистрация в плане обмена - можно ли как нибудь перепровести документ и отменить регистрацию в обмене?

Или можно только запретить авторегистрацию - и делать регистрацию через подписки?

А вообще хочется что бы при групповом перепроведении в ЦБ - документы не улетали в периферийную базу.

зачем групповое перепроведение делаешь?

(1) Нужно.
А  какая разница?

Можно

(2) В зависимости от цели возможно есть способы, удовлетворяющие твоим потребностям, при этом без этих проблем которые сейчас у тебя.

(3)  Цель - восстановить себестоимость товаров по 41 счету в ЦБ, в связи с регулярными изменениями вносимыми задним числом в реализации.
В периферийных базах ведется только количественный учет - им результаты перепроведения до лампочки.
Соответственно есть желание не гонять туда сюда документы после группового перепроведения

(3)  а как?

(6) ПланыОбмена.УдалитьРегистрацию<Что-то там>
ищи в СП.

(7)  Спс. кажется то что нужно

(8) только лишнего не удали.