Подскажите, как сделать отбор в журнале расчетов "зарплата" по внутр. совместителям.

^

Сделать журнал общим

(2) тогда уж - создать второй журнал, но уже общий, а первый - не трогать, ибо - работает! :)

а в существующем журнале отображаются совместители?

Отображаются, только не через отбор.
Надо установить видимост ЖР по объекту и в справочник сотрудников встать на совместителя, потом перейти в ЖР