Была старая база БП 2.0 с измененной конфигурацией. Копию этой базы обновили до последней с переносом изменений. Сейчас задача убедиться что обновление прошло нормально, в особенности что ни какие данные не потерялись и не испортились.
Посоветуйте какими методами это можно сделать чтобы точно гарантировать отсутствие косяков?

странный вопрос..

Я думаю, первое что нужно сделать, включить мозги еще на этапе сравнения  и объединения конфигурации...

(0) Во первых - Оборотка. Потом важные отчет открывать в обновленно йи необновленной и смотреть разницу. А вообще про автоматическую сверку не слышал. Написать свою обработку по сверке остатков и оборотов по счетам, хотя бы по основным - 01,02, 50,51,60,62, 70,71 ,91 и т.д.

А реквизиты как проверять ?

(4) сравнить еще раз  - обновленную со старой. и посмотреть, есть ли удаленные реквизиты