Есть параметр НачалоПериода, на вкладке Параметре в колонке Выражение написал, например, "ДОБАВИТЬКДАТЕ(&НачалоПериод, "День", 1). Параметр вынесен на форму отчёта.
Открыл отчёт, установил дату: 27.09
Когда нажимаю выполнить, к этой дате прибавляется день, и уже СКД работает с новым параметром: 28.09. Но на листе отчёта будет написано? НачалоПериода: 27.09

Как обойти?

смысл непонятен. Зачем каждый раз прибавлять день?

Перед формированием добавьте в параметр НачалоПериода 1 день.
и там тоже будет 28.09 :)

(1) Это примерю
(2) Т.е. только программно?