Есть ли предопределенная процедура, в которой я могу отследить то, что происходит с документом: проведение, отмена проведения(отмена проведения, пометка на удаление документа)? Мне надо привязать реквизит одного справочника, к состоянию документа.

при записи что ли?

их несколько. ставь свою процедуру в них.

а вообще менять реквизит при проведении документа - у вас что-то в консерватории не то.

для таких вещей есть регистры сведений

Сумбурная формулировка. Обработчик "ПередЗаписью" не то что ты хочешь?

или ПередЗаписью

Да, но чтобы отслеживать все. Проведение интерактивное и не интерактивное.

(5) Ну и отслеживай, в обработчике

а не пофих ли документу на интерактивность?

Кстати, только (4) не обойтись:
запись помеченного(ранее) на удаление не отличить с пометкой на удаление и наоборот, запись(просто) не помеченного со снятием пометки.

Разве сверяться со Ссылка.ПометкаУдаления или при создании объекта "в памяти" в переменной сохранять или в доп свойствах