В документы поступления/реализации автоматически ни при открытии ни при выборе контрагента не ставятся счета учета расчетов. Регистр заполнен.

А записи в регистре без выбранных организаций?

С выбраной. У меня одна организация.

У меня 5 баз. В 3-х нормально. В двух счета не стявятся.

А записи есть для всех видов расчетов?

Да, был для всех.
Сейчас по модулю лазила, нашла, что при открытии докумена вызывается функция, в которой проверяется вид расчета. У меня где-то указан "Расчеты в валюте регламентированного учета". Указала сейчас конкретно этот вид расчета - счета стали подставляться при выборе контрагента. Только не могу найти, где я указала этот вид расчета :(

(5) При выборе контрагента вид расчетов, на которые надо получить счета, определяется из параметров договора этого контрагента. А точнее, если в договоре валюта = валюте взаиморасчетов, то берутся счета учета с вида расчета "Расчеты в валюте регламентированного учета"

Кстати, в регистре "Счета учета расчетов с контрагентом" вид расчета должен быть заполнен.
Кроме единственного случая, когда в записи также не заполнены организация, контрагент и договор, т.е. для общего случая.

(6) У меня в базах, в которых счета проставляются, вообще регистр не заполнен. Просто в этих кто-то заполнил. И только сейчас пожаловались, что автоматически ничего не ставится.

Спасибо :)

Точнее они заполнены, просто в списке не отображаются при выбраной основной организации. Вот теперь совсем все понятно :)