Подскажите может кто реализовывал такую штуку. Нужно сделать чтобы каждый пользователь базы мог видеть только структуру своего предприятия в справочники.

(0) если ты про БП, то в типовой такой механизм по идее есть, смотря что тебе надо, ты про подразделения или про все справочники?

Указываешь в настройках пользователя основную организацию, снимаешь там же флаг Вести учет по всем организациям, создаешь группу пользователей, для которой в правах на закладке Организации указываешь только одну организацию. Добавляешь в эту группу пользователей, выгоняешь всех нах из базы, пускаешь снова.

Я имею ввиду и про документы и справочник тоже

(3) если правильно сделана настройка прав по организациям, то пользователи будут видеть только документы по организации на которые есть права.

По справочникам сложнее и смысл, да и вопрос не акцентирован, что значит "структуру своего предприятия в справочники."

это на какай язык переводить надо, чтобы въехать в сакральный смысл проблемы?

Ну да со справочником наверно смысла нету. А вот с документами есть