Есть 1С7
Конфигурация: Сельскохозяйственное предприятие ред.4

При оприходовании материала и установки суммы, НДС ставится в число 99,99

Скажите куда глядеть что бы дать вам более подробную картину.

вообще ничего не понятно из вопроса....

Чота у автора куда не глянь - все программы неверно считают! Может, работу сменить?

P.S.  В отладчик смотреть надо...

Смотреть в "Настройки пользователя", "Константы" и т.п.... может в самой номенклатуре есть настройка НДС

а че 99,99% НДС - это просто мечта какая-то :)

(4) при оприходовании - да, а вот при реализации....

(5) а пофиг,  главное с чьей точки зрения смотреть... а то ишь-ты, квартир, машин себе накупили панимашь, скрово ваще забудут кто перед кем ку делать должен ;)