При снятии галки:
Настройка параметров учета -> Запасы -> Настройка аналитического учета -> галка "Ведется учет по партиям (документам поступлениям)"

И нажатия кнопки Применить система уходит в себя.

По другим базам с аналогичной конфигурации (почти типовая с небольшими доработками) снятие галки произошло без проблем. После нажатия кнопки Применить система заканчивала перерасчет за 10 мин.

Пробовали: перезагружать базу через Конфигуратор (Выгрузить - Загружить), Тестирование ИБ с удалением битых ссылок. Тестирование ИБ с восстановлением объектов по битым ссылкам также заканчивается ошибкой: Ошибка SDBL: Выход за пределы размерности результата.

Какие еще пути решения могут быть предложены?

(0) Попробовать на другом релизе платформы?

(0) При снятии галки партионного учета изменяются субконто в плане счетов. Ваша тема v8: Рушится логическая целостность при добавлении субконто