Ошибка при выполнении расширения, ругается ошибка применения модуля ..... не соотвествует методу.
Но при этом выполняется нужная процедура с директивой ИзменениеИКонтроль.
Все выполняется правильно, только всех смущает ошибка, она появляется 1 раз когда запустить базу, следующий раз после следующего запуска.
Можно как то избавиться от нее?

Можно. Исправить расширение.

&Вместо

(2) &Вместо такая же ошибка.

(1) как исправить?

(4) План такой:
1. Прочитать внимательно ошибку.
2. Открыть код
3. Основательно подумать.
4. Исправить.

(4) скопировать процедуру полностью с директивой &Вместо..
исправить куски кода. где надо.. поставить свои комментарии.. чтобы при следующем обновлении не забыть..

Подскажите как правильно переделать изначально процедура была такая
УчетЗарплатыПереопределяемый.ДополнитьТаблицуЗарплатыАналитикойБухУчета(ТаблицаЗаработнойПлаты)
переделал на такую, т.к. необходимо было добавить доп данные
УчетЗарплатыПереопределяемый.Доп1_ДополнитьТаблицуЗарплатыАналитикойБухУчета(ТаблицаЗаработнойПлаты, ПериодРегистрации);
Если у последней процедуры убрать период регистрации, тогда не ругается.

состав параметров заимствованной процедуры не должен меняться..

(7) "как правильно переделать"
Для начала документацию почитать...

(7) надо создать общий модуль в расширении.. туда написать новую процедуру по образу и подобию оригинальной.. и сделать вызов этой новой процедуры..

(10) И попутно затащить в расширение еще пару десятков модулей, зависимые процедуры из которых внезапно станут экспортными =)
Кстати даже интересно стало, "экспорт" в сигнатуру входит? Не будет ли опять той же проблемы?

(7) Переписываешь свою расширяемую процедуру так, чтобы она принимала на вход в ТаблицаЗаработнойПлаты структуру. Проверяешь тип параметра.
Если прилетает не структура, то это обычный вызов, надо отрабатывать все по старому. Если структура, то извлекаешь оттуда свои ТаблицаЗаработнойПлаты и ПериодРегистрации и делаешь то, что хотел.

(11) это навскидку.. думаю.. там всё проще.. но пусть сами разбираются

(12) вызов тоже придется переделывать..

(14) Естественно. А как он иначе, даже в своей исходной постановке, будет свой новый параметр ПериодРегистрации передавать?