Последнее обновление на базе майское, декларацию НДС просят срочно, база сильно перепиленная, я тут недавно. Можно ли точечно это обновить? Если да, то как лучше это сделать?

Лучше всего позвать того, кто знает, как это сделать.
И да - пообещать ему (не)много денег.

(0) "Если да, то как лучше это сделать?" Лучше обновлять целиком.

как считаете, можно ли главбуху предложить такой вариант, поставить грубое обновление на тестовую базу, там отчетность точно будет работать, она сдаст ндс, потом через некоторое время поставить обновление на рабочую базу, сможет сдать уточненную?

(3) предложить можно:)

(0) выгрузи в бух и сдай оттуда

(0) Увольняйся и ищи на +10к к карме ;)

+

(3) можно обновить копию, можно сделать декларация внешним отчетом из текущего релиза
оба варианта используются

(8)
а где такой внешний отчет найти, не подскажете?

(9) самому сделать - выгрузив из Релиза и подрихтовав код
возможно 1С выпускала как внешний декларацию в момент смены релизов - искать на ИТС
возмлжно есть на Инфостарте