Запрос=Новый Запрос;
Запрос.Текст="ВЫБРАТЬ
                 |    ПриходнаяНакладная.Ссылка
                 |ИЗ
                 |    Документ.ПриходнаяНакладная КАК ПриходнаяНакладная
                 |ГДЕ
                 |    ПриходнаяНакладная.Дата МЕЖДУ &Дата1 И &Дата2
                 |    И НЕ ПриходнаяНакладная.ПометкаУдаления
                 |    И ПриходнаяНакладная.ДокументДоп = Неопределено";

Долго работает запрос, можно ли его ускорить? Проблема в "Неопределено" ?
ДокументДоп - составного типа

долго это сколько?
С условием и без

(0) и тип документДоп скажи

(0) ДокументДоп - имеет составной тип:
ДокументСсылка.Документ1, ДокументСсылка.Документ2, ДокументСсылка.Документ3, ДокументСсылка.Документ4, ДокументСсылка.Документ5

(1) Долго - это 97% от работы всей процедуры.
Если заменить
И ПриходнаяНакладная.ДокументДоп = Неопределено

На

И ПриходнаяНакладная.ДокументДоп Есть NULL

То работает очень быстро, но неправильно

переписать на объединение всех типов не вариант?

а если будет не неопределено, а пустая ссылка?

зы. просто добавить реквизит булево ЗаполненДопДокумент сложно?
или регистр ПриходныеНакладныеБезДопДокументов?

(4) тогда уж
ПриходнаяНакладная.ДокументДоп.Ссылка Есть NULL

но это как раз должно быть очень медленно

97% - это ни о чём не говорит, если в остальной части нет обращений к данным

ДокументДоп индексирвано?

(4) Запрос.Текст="ВЫБРАТЬ
                 |    ПриходнаяНакладная.Ссылка,
                |    ПриходнаяНакладная.ПометкаУдаления,
                |    ПриходнаяНакладная.ДокументДоп
ПОМЕСТИТЬ ПрихНакладная
                 |ИЗ
                 |    Документ.ПриходнаяНакладная КАК ПриходнаяНакладная
                 |ГДЕ
                 |    ПриходнаяНакладная.Дата МЕЖДУ &Дата1 И &Дата2
                 |;

|ВЫБРАТЬ
                 |    ПрихНакладная.Ссылка

                 |ИЗ
                 |    ПрихНакладная КАК ПрихНакладная
                 |ГДЕ
                 |    НЕ ПрихНакладная.ПометкаУдаления
                 |    И ПрихНакладная.ДокументДоп = Неопределено";


так попробуйте

+ (9) или так, интересно
Запрос.Текст="ВЫБРАТЬ
                 |    ПриходнаяНакладная.Ссылка
                 |ИЗ
                 |    Документ.ПриходнаяНакладная КАК ПриходнаяНакладная
                 |ГДЕ
                 |    ПриходнаяНакладная.Дата МЕЖДУ &Дата1 И &Дата2
                 |    И НЕ ПриходнаяНакладная.ПометкаУдаления
                 | СГРУППИРОВАТЬ ПО ПриходнаяНакладная.Ссылка
                 | ИМЕЮЩИЕ
                 |    ПриходнаяНакладная.ДокументДоп = Неопределено"

(4) но обычно так и есть. запрос всегда занимает 97% от процедуры. Если там 2 запроса, то примерно по 48% каждый, и так далее.

(4) озвучь уже время. Хотя бы порядок - секунды- десятки секунд - минуты

(12) и нет ли проброса данных сервер-клиент? ну там ТЧ обработки какой-нибудь...

(4) А в чем неправильность?

(14) очевидно результат пустой.

(0) Не следует делать условия на поля составных типов.

(16) Ой, я ошипся, это не тот случай.

Конкретно в этом случае скорее всего непопадание в индекс и скан таблицы или ведро нестед лупсов, там как оптимизатор решит.
Нет покрывающего индекса на поля
Ссылка
Дата
ПометкаУдаления
ДокументДоп

(18) а если бы был, он бы помог в случае
|    И НЕ ПриходнаяНакладная.ПометкаУдаления  ?

(15) Ну это не совсем очевидно)))

А если сделать так?
ВЫБРАТЬ
ПриходнаяНакладная.Ссылка,
ТипЗначения(ПриходнаяНакладная.ДокументДоп) Как Тип
Поместить ВТ
ИЗ
Документ.ПриходнаяНакладная КАК ПриходнаяНакладная
ГДЕ
ПриходнаяНакладная.Дата МЕЖДУ &Дата1 И &Дата2
И НЕ ПриходнаяНакладная.ПометкаУдаления

ИНДЕКСИРОВАТЬ ПО
    Тип

Ну а следующим запросом уже выбрать необходимое?

(0)
условие сделать первым в ГДЕ

ПриходнаяНакладная.ДокументДоп = Неопределено

(21) на порядок условий вообще пофиг...

(20) блин....по типу нельзяиндексировать