Должна ли быть нумерация счетов фактур сквозной, или мы можем выдавать сч.ф. с номерами с разными префиксами в рамках одного подразделения/организации?
А то что-то из "Постановление Правительства РФ от 26 декабря 2011 г. N 1137
"О формах и правилах заполнения (ведения) документов, применяемых при расчетах по налогу на добавленную стоимость"

C изменениями и дополнениями от:
28 мая, 24 октября 2013 г., 30 июля, 29 ноября 2014 г. "
нифига не понятно

(0) "Должна ли быть нумерация счетов фактур сквозной"
Если ты имеешь ввиду нумерацию в хронологическом порядке без пропуска номеров, то нет, не должна.

(0) Номер должен быть порядковым, других требований не встречается

(1) а еще с разными префиксами? например выставить клиенту сч.ф. А/1 А/2 Б/1?

одному и  тому же

и по одному договору...

А зачем тебе такой изврат?

(6) из одной системы генерить первичку в кучу других.

(7) И?

(7)+ проблема в том, что первичка еще и независимо от моей системы ведется дополнительно

(8) ну, чтобы сократить направление передачи данных - не грузить номера из одной системы для выгрузки в качестве входящих в другую систему, а назначать их директивно. Ну и тогда порядок обмена меньше влияет

Генери на здоровье.
- период возобновления нумерации можно установить любым: день, месяц, квартал, год и т.д.;
- в состав номера могут входить не только цифры, но и цифры с буквами, разделительные знаки.
Влепи префиксы и наслаждайся.

(11) т.е. если я в один день одному и тому же клиенту выставлю сч.ф. с номером А-0001234 и Б-00000321 - это норма и к этому вопросов не возникнет?

(12) если обоснуешь какой алгоритм ты используешь - не возникнет. главное, чтоб не дай бог у тебя не совпали нумера.

Кстати, если в день число сч-ф не сильно большое, можно использовать префикс подразделения+префикс дня. Позволит тебе напихать куда угодно сколько угодно счетов-фактур и никто в жизни не придерется.

(12) не возникнет
у меня в строительстве была сделана нумерация в пределах дня и кодирование в номере типа СФ, ФНС трясла много и плотно, по поводу нумерации СФ претензий нет по сей день

Нет. Есть только два вида документов, которым нормативно установлена непрерывная последовательная нумерация - ПКО и РКО.

(11) на самом деле, все будет зависеть от того, хотят ли к вам прикапаться или нет. Если ты помнишь, раньше авансовые счета-фактуры можно было напечатать с префиксом "А" (и сейчас в бухне это можно), и у них нумерация была отдельная. В этом году, у одного из знакомых клиентов, была такая ситуация, когда это послужило поводом отстаивать свою позицию, т.к. есть разъяснение МинФина по этому поводу, которое трактуется отсутствие как таковой, отдельной нумерации на авансы. В твоем случае, это про пример с номерами А-0001234 и 0001234. Я, после того, как узнал про этот случай, решил полюбопытствовать в самой цитадели, что там думают на этот случай. Оказалось, тема не нова, и смысл вообщем-то такой же, как я и описал выше: возможность вести раздельную нумерацию в конфе из коробке есть, а её использование влечет за собой право отстаивать свою позицию во всех инстанциях. Аналогичная тема с обособками.

И в догонку, если пример с форматом номера из жизни ("А-0001234"), то надо осмыслить тот факт, что до символа "-" не должно быть значащих символов самого номера, т.к. символ "-" в номере - это разделитель префикса и собственного самого номера. А сам префикс должен быть 4-ех символьный, т.к. в нем зашиты префиксы организации и РИБ. И если тупо генерить такие номера из примера, но с значащими символами номера до "-", то они тупо будут отсекаться в самой конфе везде где только можно, и на эту тему нужно будет попариться. Лучше сам префикс подогнать под стандарт БСП, чтоб технически проблем не было.

Не совсем в тему, но близко.

Есть еще одна прикольная штука с буквами в номерах СФ. Они действительно разрешены и на практике используются.
Дело в том, что разрешены и принимаются сейчас вроде как любые буквы, в том числе схожего изображения, и в общем-то любого регистра.

А книги продаж и покупок сдаются электронно, а номера входящих счетов бухгалтеры часто заносят руками.

В результате ваши контрагенты у себя могут поставить русскую О, а не английскую (на бумаге-то же не видно!).

И так и отсдаются. А у всех органов в том числе и ФНС, сейчас модно стоить цепочки по своим данным, что им насдавали.

ФНС вроде даже заявляла о том что они явно будут как-то обрабатывать такие ситуации на своей стороне, потому как по закону продавцам/покупателям по человечески предъявить нечего.

По путевому, они должны были ограничить использование символов в номерах документов каким нибудь законом или указом, как это сделано, например, для автомобильных номеров.