Пишу кусочек кода, а реализации одна строчка в которой кол-во = 2
А вопрос выводит как 1

Не совсем понимаю, что не так, но  такое  ощущение что в отборе.

"ВЫБРАТЬ
        |    РеализацияТоваровУслугТовары.Количество КАК КоличествоРеализованныхТовары,
        |    РеализацияТоваровУслугТовары.Номенклатура.ВидНоменклатуры КАК ВидНоменклатурыРеализованных,
        |    РеализацияТоваровУслугТовары.Номенклатура КАК Номенклатура,
        |    РеализацияТоваровУслугТовары.Склад КАК Склад
        |ИЗ
        |    Документ.РеализацияТоваровУслуг.Товары КАК РеализацияТоваровУслугТовары
        |ГДЕ
        |    РеализацияТоваровУслугТовары.Ссылка.Дата МЕЖДУ &НачПериод И &КонПериод
        |    И (РеализацияТоваровУслугТовары.Номенклатура = &Номенклатура
        |            ИЛИ РеализацияТоваровУслугТовары.Номенклатура.Родитель В ИЕРАРХИИ (&Номенклатура)
        |                И РеализацияТоваровУслугТовары.Номенклатура.ЭтоГруппа = ЛОЖЬ)";

Печально

(2) да

(0) да вы, батенька, поэт

(4) возможно и косячу

(4) сказал как отрезал

ну согласен я лох, но а проблема в коде есть?

(7) последние две строчки как-то взаимоисключающиеся. не?

хотя, нет

(7) еще какая

(7) вопрос на вскидку, почему именно документ, а не скажем, ну хотя бы регистр?

ы условиях что-то не то, да. Убирай всё и добавляй по одному, увидишь где косячит

Что может быть не так с запросом, если выводит КОЛИЧЕСТВО=1, а в документе глазами видится 2? Очевидно, что в запросе и глазами смотрятся разные реквизиты.

Или разные документы.
Или базы.

Изменения в документе сохранены / записаны?

(13) вот ни разу не очевидно. может, в запросе используется поправочный коэффициент

Последние две строчки запроса явно не нужны. Вы же в табличной части используете только номенклатуру.

(13)+1.
(0) Ты точно глазами смотришь на ту реализацию, которая в этом периоде

РеализацияТоваровУслугТовары.Ссылка.Дата МЕЖДУ &НачПериод И &КонПериод

И в периоде может быть и не одна реализация.

Добавь еще в Выбрать вывод документа

|    РеализацияТоваровУслугТовары.Ссылка КАК ДокРеализации,

для проверки.